1.粪便常规检查：大便显微镜检查，注意有无脓细胞，白细胞，红细胞与吞噬细胞，还应注意有无虫卵，寄生虫，真菌孢子和菌丝，有时需反复几次才有意义，有助于腹泻病的病因和病原学诊断。
2.大便培养：对确定腹泻病原有重要意义，1次粪便培养阳性率较低，需多做几次，新鲜标本立即培养可提高阳性检出率。
3.大便乳胶凝集试验：对某些病毒性肠炎有诊断价值，如轮状病毒，肠道腺病毒等，有较好敏感性和特异性，对空肠弯曲菌肠炎的诊断有帮助。
4.酶联免疫吸附试验：对轮状病毒有高度敏感性，特异性，有助于轮状病毒肠炎和其他病毒性肠炎诊断。
5.聚丙烯酰凝胶(PAGE)电泳试验：此法可检测出轮状病毒亚群及不同电泳型，有助于轮状病毒分类和研究。
6.粪便还原糖检查：双糖消化吸收不良时，粪便还原糖呈阳性，pH值<6.0，还原糖检查可用改良斑氏试剂或Clinitest试纸比色，继发性双糖酶缺乏远较原发性多见，原发性者以蔗糖-异麦芽糖酶缺乏最常见。
7.粪便电镜检查：对某些病毒性肠炎有诊断价值，如轮状病毒性肠炎，诺沃克病毒性肠炎等。
8.血白细胞计数和分类：病毒性肠炎白细胞总数一般不增高，细菌性肠炎白细胞总数可增高或不增高，半数以上的患儿有杆状核增高，杆状核大于10%，有助于细菌感染的诊断。
9.血培养：对细菌性痢疾，大肠埃希杆菌和沙门菌等细菌性肠炎有诊断意义，血液细菌培养阳性者有助于诊断。
10.血生化检查：对腹泻较重的患儿，应及时检查血pH，二氧化碳结合力，碳酸氢根，血钠，血钾，血氯，血渗透压，对于诊断及治疗均有重要意义。
11.其他：对迁延性和慢性腹泻者，必要时作乳糖，蔗糖或葡萄糖耐量试验，呼气氢试验(一种定量非侵入性测定碳水化合物吸收不良的方法，有条件可以应用)，也可作纤维结肠镜检查。
