1.临床检查
结膜充血，透明度降低，结构模糊，结膜囊内分泌物增多，睑结膜乳头滤泡形成，部分患者同时伴有眼睑水肿结膜下出血、伪膜形成等。
2.细胞学检查
在一些特殊的结膜炎，可以行结膜分泌物的涂片或结膜面的刮片检查，如嗜酸粒细胞增多，支持过敏性结膜炎诊断;细胞胞质内包涵体则支持沙眼等。
3.病原学检查
包括结膜囊分泌物培养、病毒分离及其抗原检测等，在培养的同时可以行药敏实验，以指导临床用药。
