磺胺药和利福平对衣原体有效，对UU无效，而大观霉素和链霉素对UU有效，对衣原体无效，衣原体培养阴性但UU培养阳性的尿道炎病人对磺胺，利福平疗效差，但以大观霉素或链霉素治疗时，若UU被清除则临床症状改善，UU未被清除则临床无改善。人类尿道中接种UU后发生尿道炎和短暂的血清抗体反应，米诺环素(二甲胺四环素)治疗有效，说明某些支原体在自然条件下具有致病性，将UU接种于非人类的灵长类动物尿道中能够再分离出支原体，尿道拭子涂片见中性粒细胞增高。
本病发病机制不明，经血清型研究发现UU至少有14种血清型，从NGU病人中分离的UU以血清型4最常见，血清型4也与无症状性脓尿有关，UU可引起部分NGU(10%～30%)，但是UU常在无尿道炎人群的尿道中检出，推测仅某些血清型致病，病人可能为第一次接触该病原体，或存在某种促发因素，如黏膜免疫缺陷，此外，UU所致的尿道炎可以是亚临床性的和自限性的，另一种从人类生殖道分离出的支原体为MG，部分衣原体阴性，UU阴性患者可能由该支原体致病，尤其是某些经久不愈的NGU病例，有资料认为，人型支原体与卵巢脓肿，输卵管炎，脓肿，出血性膀胱炎有密切关系，UU还可引起前列腺炎，附睾炎和不孕症，尿路结石，肾盂肾炎等，临床上MH和UU引起生殖器以外的感染亦不少见，已发现在肾移植，创伤和泌尿生殖道器械操作后发生MH败血症者。
