胃畸胎瘤病因一直未阐明，然而一般认为与来自身体任何部位畸胎瘤不同，因为它与背部体轴，胚胎体壁和胸腹无关，而是来自内脏壁，这可能是其他部位畸胎瘤恶性约占1/4，而胃畸胎瘤通常是良性的原因。
发病机制
与其他部位畸胎瘤一样，胃畸胎瘤含有三个胚层成分，这些成分大部分主要是成熟组织，但是有些神经组织显示原始未成熟结构，不同在于一般认为本病是良性的，而且从发现发展到恶性，尽管通常见到未成熟的神经组织，少数病例病理报道为未成熟型畸胎瘤，但临床上都证实为良性，单纯的肿瘤切除，而不加用化疗效果良好，年龄，性别和大体形态，梗阻症状，胃肠道出血和X线表现都不是本病恶性的可靠征象，Moriuchi综合了40例胃畸胎瘤，70%胃畸胎瘤向胃外生长，16%胃内外生长，14%胃内生长，而所有来自前壁的肿瘤都向胃外生长，向胃内生长的肿瘤由于黏膜溃疡可引起呕血和黑便症状。
