一、肿瘤筛查
肿瘤筛查就是从无症状人群中寻找可疑者。肿瘤标志物检测是肿瘤初筛的有效方法。常用于高危人群筛查。
肿瘤标志物异常升高，无明显症状和体征，需进行复查、随访。如持续增高，应及时确诊。
二、诊断
辅助诊断：肿瘤标志物的特异性不够强，不能单纯依据肿瘤标志物确诊肿瘤，但可提供进一步诊断线索。
鉴别诊断：本-周氏蛋白、AFP、HCG、PSA等具有特征性癌谱。
不能定位诊断：肿瘤标志物缺乏组织器官特异性。
动态观察：肿瘤标志物进行性升高具有明确诊断意义;良性疾病的标志物升高为一过性;恶性肿瘤的标志物升高为持续性。
三、监测病情和疗效
监测疗效、复发转移是肿瘤标志物最重要的临床应用。肿瘤患者经手术，化疗或放疗后，特定的肿瘤标志物含量升降与疗效有良好的相关性，通过动态观察可反映肿瘤有无复发、转移。
