诊断标准
小肠内细菌孳生的诊断：
1.十二指肠，上段空肠消化液细菌培养：优点是可以直接测定细菌数，缺点有创性，容易污染。
2.14C甘氨胆酸盐呼气试验：给病人口服5UCi l4C甘氨胆酸盐，经小肠内细菌分解14C甘氨酸，14C甘氨酸经细菌酶作用，在肠腔内代谢产生14CO2，经肠黏膜吸收入血，在口服14C甘氨胆酸盐lh后，14CO2经肺呼出，呼出14CO2可直接测定，呼出14CO2增加表示不结合胆酸增加，不结合胆酸增加可能由于小肠细菌孳生过度产生，小肠细菌孳生综合征病人呼出14CO2比正常人大10倍，因此14C甘氨胆酸盐呼气试验对胃切除后小肠腔内细菌孳生过度诊断有帮助。
3.14C木糖呼气试验：木糖主要在近段空肠吸收，如果分解增加，说明小肠腔内细菌孳生过度，在小肠细菌孳生综合征病人中，试验开始60min内呼出气中14CO2增加，本试验被认为是诊断小肠细菌孳生综合征首选的试验，具有较好灵敏性和特异性。
鉴别诊断
1.慢性肝胆疾病：如慢性肝炎，肝硬化及肝内外胆管梗阻等，可因胆盐的缺乏，使脂肪不能乳化及转运，故可导致脂肪泻。
2.小肠疾病：小肠切除过多(如小肠被切除全长的75%以上或仅剩余120cm时，称为短肠综合征)，胃，结肠瘘或胃，回肠瘘都可因小肠的吸收面积减少，或食物不经过小肠或空肠而经瘘管直达结肠，最终均可导致腹泻。
