根据临床败血症的诊断，结合肾功能衰竭的临床表现，实验检查阳性结果可以诊断本病，对临床怀疑为败血症的病人，应作血和脓液的细菌培养检查，如果所得的细菌相同，则诊断可以确立，但很多病人在发生败血症前已接受抗菌药物的治疗，往往影响到血液细菌培养的结果，以致一次培养很可能得不到阳性结果，故应在1天内连续数次抽血作细菌培养，抽血时间最好选择在预计发生寒战，发热前，可以提高阳性率，必要时，可抽骨髓作细菌培养，对临床表现极似败血症而血液细菌培养多次阴性者，尚应考虑厌氧菌或真菌性败血症的可能，对怀疑有厌氧菌败血症者，可抽血作厌氧菌培养，对疑有真菌性败血症者，可作尿和血液真菌检查和培养，并作眼底镜检查，在真菌性败血症，眼底视网膜和脉络膜上常有小的，白色发亮的圆形隆起。
败血症应注意和胃肠道感染，中毒型菌痢，重症伤寒，粟粒性结核，脑炎和隐性局部感染灶等相鉴别，败血症肾损害应与其他感染性肾脏疾病相鉴别。
