不孕
输卵管囊肿生长到一定阶段，就会引起输卵管粘连、堵塞，破坏输卵管的正常生理功能，从而导致继发不孕症。
宫外孕
输卵管囊肿引起管腔闭塞、囊肿或粘连，均会妨碍精子、卵子或受精卵的运行，致使受精卵到达宫腔产生障碍而发生宫外孕。患者宫外孕时引起的输卵管破裂大出血，可危及生命。
癌变
输卵管囊肿长期生长，可导致囊肿恶化、癌变。但癌变的几率不大。
