主要表现为慢性肺部感染，儿童表现为淋巴结炎，免疫抑制患者(尤其是AIDS)呈播散性感染，临床表现为发热，盗汗，体重减轻，脑病，腹痛，腹泻和贫血，皮肤表现类似结节样麻风，免疫抑制患者可见脓肿或溃疡。
分泌物或活检组织涂片可发现大量抗酸杆菌，培养检查可发现鸟分枝或胞内分枝杆菌生长。
