急性脓胸期间选用抗生素不恰当，或治疗过程中未能及时调整剂量及更换敏感抗生素，脓液生成仍较多，如果此时引流管的位置高低，深浅不合适，管径过细。或者引流管有扭曲及堵塞，引流不畅，均可形成慢性脓胸。
外伤后如果有异物，如金属碎片、骨片、衣服碎条等残留在胸腔内，或手术后异物等残留，则脓胸很难治愈，即使引流通畅彻底也因异物残留而不能清除致病菌的来源而不能治愈。
如果脓胸是继发于肺脓肿、支气管瘘、食管瘘、肝脓肿、膈下脓肿、脊椎骨髓炎等疾病，在原发病变未治愈之前，脓胸也很难治愈，形成慢性脓胸。
结核性感染、霉菌性感染、阿米巴性脓胸均容易形成慢性脓胸。
发病机制
慢性脓胸的特征是胸膜增厚，大量纤维素沉积在胸膜表面，随着成纤维细胞和血管内皮细胞的侵入，纤维素层逐渐增厚，机化及钙化，厚达数厘米，脏层胸膜紧裹于肺，严重影响肺的呼吸运动，胸廓也因壁层胸膜增厚，纤维瘢痕组织的收缩而内陷，肋骨聚拢，肋间隙缩窄，脊柱侧弯，纵隔牵向患侧，膈肌固定，从而严重限制呼吸功能，长期肺萎缩可致支气管变形，排痰不畅，继发感染可以并发支气管扩张和肺纤维化，丧失再膨胀能力和气体交换能力，导致呼吸功能减退和缺氧，脓胸也可能侵犯邻近的肺组织，产生支气管胸膜瘘或食管胸膜瘘，当大量脓液进入支气管内，患者可窒息死亡，长期的慢性感染，肝，脾，肾等脏器偶可发生淀粉样变，表现为肝脾肿大，肝肾功能衰竭，有时出现杵状指(趾)。
