一般情况下睾丸发生扭转的本质原因是生殖器官的先天畸形，本病可能与解剖畸形或发育不全有关，如睾丸鞘膜囊过分宽大、精索过长或睾丸下降不全等。
外阴部的外伤、剧烈运动甚至天气寒冷使提睾肌痉挛或体位突然改变等亦可引起睾丸过度活动，有时外力不明显，甚至在睡眠中也可以发病，可能系睡眠中迷走神经兴奋、提睾肌随睾丸阴茎勃起而强烈收缩所致。诱发睾丸扭转。
隐睾为先天性阴囊内没有睾丸，它包括睾丸下降不全、睾丸异位和睾丸缺如。睾丸下降不全系指出生后睾丸未降至阴囊底部而停留在下降途中的某一部位，包括停留在腹腔内者。临床上常将睾丸下降不全称为隐睾。睾丸异位是睾丸离开正常下降途径、到达会阴部、股部、耻骨上、甚至对侧阴囊内。
发病机制
扭转造成睾丸损伤的机制容易理解，循环障碍，静脉闭塞导致睾丸充血，肿胀，如果拖延下去，静脉血栓形成，最后动脉栓塞而组织坏死，睾丸受损害的程度与两个因素有关，即扭转的程度和持续的时间，1961年，Sonde和Lapides动物试验证明，精索完全旋转4周，2h即可产生睾丸组织的不可逆改变，而旋转1周(360°)，12h或更长时间未对睾丸产生不良影响，临床病例证据证实：在扭转持续4h后可以看到后期的睾丸萎缩，如果扭转后12h没有救治，多数睾丸将发生萎缩，但这种情况也有很大的不确定性，有些病人是间隙性的和自愈性的扭转，未造成睾丸损伤，而另一些病人可能迅速出现完全的血管梗死，并且很快出现睾丸的损伤和坏死，总之，在症状初起后4h应尽快手术探查，睾丸缺血12h后，坏死几乎不能幸免。
