由于输尿管管腔狭窄，而且还有生理性狭窄，小的结石很容易在这些狭窄部位停留造成嵌顿，输尿管结石很少会造成完全梗阻，由于结石通常为不规则的枣核形状，所以尿液一般可以从结石周围通过，依身高的不同，成人输尿管全长大约22～30cm不等，输尿管的直径不一，解剖上有3个生理性狭窄：肾盂输尿管连接部内径约2mm;输尿管跨越髂血管处内径约4mm;输尿管膀胱连接部内径约3～4mm，输尿管最狭窄的部分是通过膀胱黏膜下通道进入膀胱的部分，即输尿管膀胱壁段，输尿管可分为腹部和盆腔部，腹部指从肾盂到髂血管处：盆腔部指从髂血管处到膀胱，上述3个狭窄部分是泌尿系结石在下降过程中，最容易发生梗阻嵌顿之处，但一般来说，结石常常停留于输尿管下段5cm范围内，结石部分梗阻会引起肾盂和结石近端的输尿管扩张，如果在短时间内得以排出，便不会造成任何损害，如果停留时间过长，在早期扩张部分的输尿管平滑肌代偿增生和肥大，输尿管腔逐渐扩张，伸长，扭曲，管壁变薄;后期病变会逐渐累及肾脏，造成肾盂肾盏积水，如果时间过长，同完全梗阻一样会造成不可逆的肾功能损害。
输尿管结石的原因有地理环境和气候：尿石症的发生具有一定的地区性。山区、沙漠、热带和亚热带地域尿石症发病率较高，这主要与饮食习惯、温度、湿度等环境因素有关。
输尿管结石的原因有饮食和营养：饮食不良是形成输尿管结石的重要原因。有资料表明，饮食中大量摄入动物蛋白、精制糖，可增加上尿路结石形成的危险性。其他如脂肪、嘌呤、草酸、钙、磷、微量元素、维生素等都会影响尿结石的形成。营养状况好，动物蛋白摄入过多时，容易形成肾结石。
输尿管结石的原因有水分摄入：任何破坏水的摄入量与损失量平衡的因素如出汗过多，都会使尿液中钙和盐的过饱度增加，有利于尿结石的形成。反之，大量饮水使尿液稀释，能减少尿中晶体形成。
输尿管结石的原因有疾病：有些输尿管结石的形成与遗传性疾病有关，如胱氨酸尿症、家族性黄嘌呤尿等。
发病机制
输尿管结石多数来源于原发的肾结石，由于重力以及尿路的蠕动作用而下降进入输尿管，所以输尿管结石的成分也与肾结石相同，以草酸盐结石为主，其次为尿酸结石，原发性输尿管结石少见，多继发于一些输尿管疾患，如输尿管息肉，肿瘤，囊肿，狭窄，憩室以及巨输尿管症等，由于输尿管中尿液淤滞，在尿液积聚扩张部位形成结石。
输尿管结石形成后会对输尿管产生各种继发性损害，损伤程度视结石的大小，形状，部位，病史等而定，主要的继发病变有尿路梗阻，继发感染和上皮损伤等。
