骨关节结核病和全身结核病一样其致病菌均为结核分枝杆菌，结核分枝杆菌只有人型和牛型结核菌是人类结核病的主要致病菌，结核分枝杆菌为抗酸性，不能运动的杆菌，其特点为对异烟肼敏感并能产生烟酸和过氧化氢酶，关节结核是一种继发性结核病，多继发于肺或肠结核，因外伤，营养不良，过劳等诱因,使机体内原有结核病灶内的结核杆菌活跃经血液播散侵入关节或骨骼，当机体抵抗力降低时，可繁殖形成病灶，并出现临床症状。
发病机制
结核杆菌不能直接侵犯骨和关节，因此骨关节病变几乎都是继发的，即通过身体原发病灶的结核杆菌进入血运而潜伏在骨或关节滑膜中仍具有活力，但被纤维组织包围，处于静止状态，一旦遇到身体过度劳累，营养不良或其他疾病的侵袭加上机体免疫力下降时，潜伏的结核杆菌迅速繁殖，突破纤维组织包围，炎症扩大而发病，结核病的病理特点是由巨细胞和上皮细胞形成结节，有纤维变性的倾向和一种特殊的非液化性坏死的干酪样变，骨关节结核的临床病理过程可分为单纯骨结核，单纯滑膜结核和全关节结核三种类型，而临床上以肘关节全关节结核为居多，其次为单纯骨结核，其中以尺骨鹰嘴结核为主，肱骨外髁次之，而肱骨内髁结核少见，肘关节的单纯骨结核具有典型松质骨结核特点，以中心型为多见，边缘型少见，中心型即结核病变位于松质骨中心部，表现有炎症浸润，肉芽，干酪样物，脓液和小死骨，死骨吸收后形成空洞，其周围骨质轻度致密，边缘型即病变位于松质骨边缘部，此处血运丰富，死骨易被吸收，形成骨质缺损和脓肿，边缘型脓肿易穿破而进入关节内形成全关节结核，肘关节单纯滑膜型结核其病变发生于关节的滑膜，病变早期呈现肿胀，充血，炎症细胞浸润，关节内有浆液性渗液，晚期时滑膜肥厚为暗红色，滑膜表面有乳突样增生和结核结节，有干酪样坏死，关节腔内有脓性渗液，单纯骨结核和全关节结核，未得到有效治疗可破溃形成窦道，多发生于肘后方鹰嘴附近，同时发生混合感染，肘关节破坏严重时，可发生病理性脱位，当病变趋向治愈时，多发生非功能位的纤维强直或骨性强直。
