黄磷毒性甚剧，对成人的最小致死量约为60～100mg，磷化锌的致死量约为40mg/kg。黄磷进入人体后，其毒理作用为破坏细胞内酶的功能，主要造成肝，心，肾等实质脏器的损害，引起上述脏器及横纹肌等脂肪变性，周围循环衰竭，骨骼脱钙及出血等，此外，黄磷对皮肤及粘膜均可引起强烈的灼伤和腐蚀，并可通过创面吸收中毒。磷化锌进入体内与胃酸作用后产生磷化氢和氯化锌，二者对胃肠道粘膜有刺激和腐蚀作用，引起炎症，充血，溃疡和出血等，其所产生的磷化氢并作用于细胞酶，影响细胞代谢，使细胞发生内窒息，以致中枢神经，呼吸，心血管系统及肝，肾功能均受影响，而以中枢神经系统受害最早亦最重。
