泌尿道真菌感染主要影响膀胱和肾。最常见的病因为念珠菌种,其为人类的正常共生菌,经常从口腔、胃肠道、阴道和损伤的皮肤中找到。然而,所有的致病真菌(如新型隐球菌、曲霉菌种、毛霉菌种、组织胞浆菌、芽生菌、球孢子菌)可作为全身性或播散性真菌感染的一部分感染肾脏。
念珠菌下尿路感染主要是因为局部尿路导尿管,一般,虽然念珠菌和细菌感染经常同时发生,但大多数Foley导尿管有关真菌感染随着菌尿及抗生素治疗后。
肾念珠菌病通常是血源性播散,常从胃肠道起源,从肾造口术的导管上行感染,其他长期留置物,支架亦会发生.高危病人是那些患肿瘤,艾滋病,化疗或用免疫抑制药物后免疫功能受损者.这类病人中念珠菌血症的主要院内感染来源是血管内留置导管.肾移植增加了真菌感染的危险性,因为其有留置导尿管,支架,抗生素,吻合漏,梗阻和免疫抑制治疗。