发病原因：
阴道内胚窦瘤可能起源于胚胎细胞，Norris称它为中肾癌，据推测此瘤可能是在生殖细胞迁移的决定期缺乏胚胎的组织导体，结果导致生殖细胞错位进入阴道上段所致。
发病机制：
肿瘤呈息肉状或质脆的脑髓样或葡萄状肿物。镜下阴道内胚窦瘤的镜下组织学结构与卵巢的内胚窦瘤同，形态具多样性，细胞呈卵圆形或多面体形伴有核大，突起，有丝分裂像呈立方形或扁平形，基本特征有：
(1)典型的Schiler Dusal(S-D)小体：即类似于“肾小球血管襻”样的结构或啮齿类动物的内胚窦结构。
(2)网状结构。
(3)透明球。
(4)抗淀粉酶PAS阳性及具嗜酸性基底膜样结构。
免疫组化可测定AFP，即此瘤能分泌甲胎蛋白(AFP)。
