1.神经系统发育缺陷：先天性腰骶部脊膜膨出或脊椎裂可伴肛门失禁，病人外括约肌和耻骨直肠肌失去正常神经支配，无收缩功能，处于弛缓状态，且由于感觉和运动系统均受影响，直肠黏膜在粪便充盈时缺乏膨胀感，不能引起便意及发动排便动作，直肠内粪便随时排出，此种病儿往往伴有尿失禁。
2.肛门直肠畸形：肛门直肠本身及盆腔结构均发生改变，且直肠盲端越高，改变越明显，越复杂，高位畸形时直肠盲端位于盆膈之上，耻骨直肠肌短缩，明显向前上方移位;内括约肌缺如或仅处于雏形状态;外括约肌多处于松散状态，其间充满脂肪组织，肌纤维走行异常紊乱，有作者随访225例肛门直肠畸形术后病儿，80例(35.5%)有不同程度的污便或失禁，畸形位置越高，失禁发生率也越高，其病因主要与畸形伴有感觉和运动神经组织结构的缺陷有关，也与手术损伤，手术错误有明显关系，过去治疗高位畸形行腹会阴肛门成形术时，直肠未通过耻骨直肠肌环，而在其后面下降，肛门直肠畸形，特别是高位畸形伴有骶骨畸形，致神经功能缺陷者也不少见，据Jiehioiiikhh分析，术后肛门失禁者约10%属此原因，中，低位畸形术后的肛门失禁，主要原因为手术损伤，感染等因素，如泄殖腔畸形，主要为女婴的直肠肛管，尿道，阴道共合一穴，以及高位无肛婴儿术后常有大便失禁，先天性痴呆，脑脊膜膨出，多发性硬皮病等均可发生大便失禁。
由于外伤损伤了肛管直肠环，使括约肌失去了括约功能而至大便失禁，如刺伤，割伤，灼伤，冻伤及撕裂伤(主要为产妇分娩时的会阴撕裂)，以及肛管直肠手术的损伤，如肛瘘，痔，直肠脱垂，直肠癌等手术损伤了肛门括约肌致大便失禁。
最常见的是肛管直肠肿瘤;如直肠癌，肛管癌，克罗恩病侵犯到肛管直肠并累及到肛门括约肌时，或溃疡性结肠炎长期腹泻引起肛管炎时，或直肠脱垂引起的肛门松弛，以及肛周的严重瘢痕影响到肛门括约肌，使肛门闭锁不全时均可引起大便失禁。
多见于脑外伤，脑肿瘤，脑梗死，脊髓肿瘤，脊髓结核，马尾神经损伤等均可导致大便失禁。
(二)发病机制
1.病理生理
排便是一个由人体多个系统共同参与协调而统一的过程，粪便到达直肠，首先直肠要有一定的顺应性，接纳粪便，正常为250ml，直肠内容物达到一定量后，刺激直肠感受器，通过传入神经纤维传入中枢，然后再经过传出神经纤维到达外括约肌及肛提肌，中枢判定条件许可，此时外括约肌松弛，腹内压增高完成排便，由于某种原因不允许排便时，则外括约肌通过随意性收缩压迫内括约肌，使内括约肌逆向反射性抑制直肠收缩，从而直肠扩张，容积增大，或通过直肠的逆蠕动将粪便推回乙状结肠，便意消失，此种由外括约肌随意收缩刺激内括约肌的逆向抑制直肠收缩称随意性抑制作用，排便是一个十分复杂的过程，任何一个环节受到损害均可造成大便失禁，如直肠的顺应性过低可导致大便次数严重增多，甚至大便失禁，顺应性过高，可致直肠容积增大，患者出现便秘，如随意性抑制作用降低亦可出现大便失禁，以及直肠感受器的异常，或外括约肌损伤均可出现大便失禁，总之，大便失禁的原因较多，还待进一步探讨。
2.分类
(1)按程度分类：根据大便失禁的不同程度：可分为完全性和不完全性肛门失禁2种，①不完全性肛门失禁：稀大便及气体不能控制，但干大便可以控制，②完全性肛门失禁：干大便，稀便和气体均不能控制。
(2) 按性质分类：根据肛门失禁的性质，分为感觉性失禁和运动性失禁，①感觉性肛门失禁：肛管括约肌的形态正常，但直肠下段感觉缺失，如脊髓或大脑中枢神经功能障碍而致的肛门失禁;或因直肠顺应性过低，大便次数严重增多所引起的肛门失禁，②运动性肛门失禁：主要为肛管外括约肌的损伤破坏了肛管直肠环，导致患者不能随意控制大便而致的肛门失禁。
