父体或母体生殖细胞不健全是主要原因，不十分健全的生殖细胞虽然勉强结合起来成为胚胎，但终会早期死亡，无法“瓜熟蒂落”，足月分娩。这种原因所引起的流产，其实可说是一件好事。因为不正常的胎儿，如果真的足月产下，也会有畸形或异常。其他原因如脐带供氧不足、羊水疾病、胎盘病毒感染以及某些妇科炎症等，也会引起流产。孕妇营养不良，也是流产的原因之一。有的孕妇早期有严重的妊娠恶心、剧吐，以致极度营养馈乏，对胚胎的发育有很大的影响，也容易发生流产。
女性怀孕后，若情绪不稳定、愤怒、忧伤等精神刺激，扰乱了大脑皮层的活动功能，引起子宫的收缩而迫出胚胎，或使胚胎在子宫内死亡。患了流感、风疹等急性传染病，会由于高烧、细菌病毒释放的毒素而致流产。内分泌失调，如黄体、脑垂体、甲状腺的功能失调，以及子宫发育不良中子宫过度后屈，致使子宫腔对胚胎的发育起了阻碍作用，都可能引起流产。
整个妊娠期间的性生活应持谨慎态度，不恰当的性生活尤其是在早孕早期易引起流产。在妊娠中期，性生活也应适度，避免压迫孕妇腹部的性交体位和粗暴性交，以免引起流产。围产期间做妇科检查时，若手法粗暴，亦是易引起流产的原因之一，这一点尤其对体质虚弱的孕妇更要注意。药物与某些化学物质，如奎宁、一氧化碳、铝、磷、汞、苯中毒，亦常使胚胎难保。
流产依妊娠日数以及当时情况分为先兆、早期或晚期、完全或不完全等几种。其中，以先兆流产最多见，发生率约占全部妊娠的50。但其真正发生流产者只占10-15，所以，有些可以保胎，有的则不宜保胎。有些虽经千方百计地保胎。最终还是流产。
从表面看流产好象是一件十分遗憾的事，但从遗传学的观点看，流产也并非坏事。因为在流产的胎儿中，染色体异常的比率相当高。
