下呼吸道感染是常见的医院感染疾病，它以革兰阴性杆菌为主，约占70%，其中又以绿脓杆菌最多。革兰阳性球菌占20%，其中以金黄色葡萄菌为常见，还有真菌与病毒。
病原体通过以下三个途径侵入患者下呼吸道：口腔和咽部的微生物侵入；含细菌的气溶胶吸入；其他部位感染的血源性播散。以下为常见病因：
以病毒为主，可占原发上呼吸道感染的90%以上，主要有呼吸道合胞病毒、流感病毒、腺病毒等。细菌感染较少见，而且常继发于病毒感染之后，主要有A组溶血性链球菌、肺炎球菌、葡萄球菌等。其中链球菌往往引起原发性咽炎，并可引发机体变态反应，导致风湿热、心肌炎、肾炎等变态反应性疾病;而葡萄球菌感染则可继发全身各个部位的化脓性感染，对机体产生极大的影响。
营养不良和缺乏锻炼，以及有过敏体质的儿童，因身体防御能力低，容易发生上呼吸道感染，特别是在消化不良、佝偻病以及有原发性免疫缺陷病或后天获得性免疫功能低下的患儿，并发这类感染时，往往出现严重的症状。因此，加强锻炼、改善营养状况与环境卫生等对预防上感极为重要。
