诊断
由于本病的症状无特异性，对小肠疾病又缺乏简单可靠的诊断方法，故诊断较困难，临床上凡有下列表现者应疑为原发性小肠溃疡：
1.有反复发作的消化性溃疡症状而胃镜和X线钡餐检查未发现胃十二指肠溃疡。
2.消化道出血或长期大便潜血阳性，但食管，胃，结肠内镜和X线钡剂检查未发现病变。
3.不明原因的小肠梗阻或肠穿孔。
4.正在或近期服用氯化钾和利尿药，出现腹痛，恶心，呕吐，腹胀，应高度怀疑小肠溃疡。
5.对有手术指征者，可行开腹探查术，术中发现小肠溃疡，术后排除其他特异性小肠溃疡有确诊价值。
鉴别诊断
1.细菌性痢疾 由志贺菌属引起，腹泻以脓血或黏液状便较常见，量少，并常有里急后重，多有寒热，粪便镜检可发现大量脓细胞，红细胞和吞噬细胞，婴幼儿中毒型菌痢或非典型菌痢应以病原学诊断来鉴别。
2.霍乱 霍乱弧菌引起感染后，先发生剧烈的腹泻而后呕吐，很少恶心，呕吐物及腹泻大便呈米泔水样，量多，无里急后重，少数患者有少量血便，脱水重者常引起肌肉痛性痉挛，皮肤皱瘪，体表温度低于正常，镜检可发现运动极活泼的弧菌，应进一步作细菌培养鉴别。
3.副溶血弧菌性食物中毒 由副溶血性弧菌引起，主要因进食被该细菌污染的食物(多与海产品有关)，起病急骤，先以畏寒，阵发性腹痛(上腹部绞痛)开始，相继呕吐腹泻，多呈水样便或血水样便，多为同餐者先后发病，应进行细菌培养鉴别。
4.沙门菌食物中毒 进食被鼠伤寒沙门菌污染食物引起，起病急，常伴有寒热，腹痛，气胀，恶心，呕吐，腹泻，呈水样便并有恶臭，早期出现菌血症，多有同餐者集体发病，依靠病原学，血清学诊断鉴别。
5.病毒性腹泻 由肠道病毒感染引起的腹泻，其特点是高度传染性，轮状病毒，小圆病毒等感染早期有呕吐，相继腹泻，多呈水样便并有黏液，多发生在秋冬季，其他病毒性腹泻多见于夏秋季，有恶心呕吐，除消化道症状外，常有呼吸道症状，咽炎，并发轻瘫，常累及颈肌，背肌，周岁内小儿多见有绿色水样便或蛋花样水便，抗生素治疗一般无效，病程多在5～7天自愈，用血清学及病毒分离进一步鉴别。
6.空肠弯曲菌性肠炎 空肠弯曲菌引起轻症与病毒性肠炎相似，重症与溃疡性结肠炎或克罗恩病相似，有发热，腹泻水样或黏液样便，有恶臭，呈胆汁色，重症有脓血便，似菌痢多在1周恢复，儿童患者常有腹绞痛，高热时可发生惊厥，发病多与接触家禽，家畜或饮用未消毒牛奶，生水有关，暗视野镜检可发现射箭样活泼动力的弯曲菌，细菌培养进一步诊断。
7.耶尔森菌肠炎 多见于儿童发病，与食物，水污染有关，腹痛，腹泻，低热，呈水样便，可有败血症，可并发结节性红斑，假性阑尾炎，关节炎，细菌培养可进一步鉴别。
8.其他 应注意与贾第鞭毛虫，阿米巴痢疾引起的腹泻鉴别，粪便镜检可发现阿米巴原虫或贾第鞭毛虫。
