由于肾绞痛常伴有恶心、呕吐、腹胀等消化道症状，易与急腹症混淆，因此在诊断中应注意排除下列常见的急腹症：急性阑尾炎、急性胆囊炎和急性胰腺炎；女患者还应除外卵巢囊肿蒂扭转、宫外孕、急性输卵管炎等。
经尿常规和B超检查，一般可确定是否肾绞痛，其中尿常规中“红细胞++”即提示有意义。如果只是一个+或女患者处于月经期间，这个结果就不能作为诊断依据。在没有得到确诊之前不能反复使用止痛药，否则影响对病情的观察，甚至延误诊断。
