组织活检可以确诊。
病理检查结果可见鳞状上皮向外过度生长形成乳头，而不向深层组织扩展，在乳头中央有纤维血管中心，乳头表面为过度角化的鳞状上皮，胞浆略嗜碱，核染色质较丰富，无间变，基底细胞排列整齐。儿童乳头状瘤极少数可恶性变，瘤细胞有间变。
