1.血液检查
急性肾盂肾炎常有血白细胞总数和中性粒细胞比例明显增高，血沉增快，C反应蛋白>20mg/L，膀胱炎时上述实验指标多正常。
2.尿常规检查
清洁中段尿离心镜检中白细胞≥5个/Hp提示尿路感染，若见白细胞管型，提示肾盂肾炎，肾乳头或膀胱炎可有明显血尿，尿路炎症严重者，可有短暂明显的蛋白尿，部分病儿可有血尿或终末血尿。
3.细菌学检查
尿培养是确定诊断的重要证据，要求在抗生素应用前做，排尿前勿多饮水，留尿过程中要严格按常规操作以免尿液污染，尿培养因可受前尿道和尿道周围杂菌的污染，故需在治疗前做清洁中段尿培养及菌落计数，若菌落计数≥10万个/ml有诊断意义，1万～10万个/ml为可疑，但已有膀胱炎尿路刺激症状的患者，尿白细胞明显增多，尿培养菌落计数为1000～1万个/ml亦应考虑尿感的诊断，此外，某些革兰阳性球菌如肠链球菌分裂慢，如为1000个/ml亦可诊断尿感，对婴幼儿和新生儿以及怀疑尿感而留尿困难的小儿，可做耻骨上膀胱穿刺培养，阳性培养即有诊断意义，留做细菌培养的尿若不能及时送验时，应暂放4℃冰箱内，否则会影响结果，有发热的尿感应同时做血培养，大量利尿或已应用抗菌治疗，则影响尿培养的结果，送尿培养如培养阳性应做药物敏感试验，指导治疗。
4.尿直接涂片找细菌
用一滴均匀新鲜尿液置玻片上烘干，用亚甲蓝或革兰染色，在高倍或油镜下每视野若见到细菌≥1个，表示尿内菌落计数>10万个/ml，根据尿沉渣涂片革兰染色及细菌形态可作为选用药物治疗的参考。
5.菌尿辅助检查
尿液亚硝酸盐还原试验，可作为过筛检查，阳性率可达80%。
6.其他检查
肾小管损伤的其他实验室指标，尿β2-mG，尿N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶(NAG)增高，尿渗透压降低提示肾盂肾炎。
7.B超检查
可探查泌尿系的结构和膀胱排泄功能有无异常，有无结石，梗阻，残余尿等引起感染的诱因。
8.X线检查
静脉肾盂造影可显示泌尿系统有无先天畸形(如重肾，多囊肾等)，肾盂积水及其程度，了解肾的大小，有无肾盂肾盏变形等慢性炎症和肾瘢痕证据，对<5岁的第一次尿感应做排泄性膀胱造影，以发现膀胱输尿管反流及后尿道瓣膜等尿感诱因。
9.核素检查
核素99m锝二巯基丁二酸(99mTc-Dimercaptosuceine acid，DMSA)肾静态显像可作为上尿路感染诊断的可靠指标，对发现肾盂肾炎的敏感性和特异性均在90%以上，当急性肾盂肾炎时肾的轮廓正常，由于肾实质的炎性细胞浸润，肾间质水肿，肾小管细胞坏死致DMSA减少，造成病变部位同位素分布的稀疏区，当炎症消散后此种稀疏区可消失，在慢性肾盂肾炎，肾瘢痕形成时，病变部位的DMSA摄入更少，且肾外形可因瘢痕收缩而缩小或见楔形缺损区。
