腹泻常导致营养不良，多种维生素缺乏和多种感染。
1、消化道外感染
消化道外感染可能是腹泻的病因，但也常因腹泻后全身抵抗力低下而受感染，常见的有皮肤化脓性感染，泌尿道感染，中耳炎，上呼吸道感染，支气管炎，肺炎，静脉炎和败血症，病毒性肠炎偶有并发心肌炎。
2、鹅口疮
病程迁延或原有营养不良的患儿易并发鹅口疮，尤在长期使用广谱抗生素后更多，如不及时停药，真菌可侵及肠道，甚至引起全身性真菌病。
3、中毒性肝炎
腹泻病程中可出现黄疸，多见于原有营养不良的患儿，可能大肠杆菌引起的肠炎，并发大肠杆菌败血症，导致中毒性肝炎，腹泻后病情很快加重，出现黄疸后很快死亡，但如及早发现及时注射多粘菌素，氨苄或羧苄青霉素，多数可治愈。
4、营养不良和维生素缺乏
腹泻迁延日久，或反复多次禁食，长期热量不足，易导致营养不良，贫血和维A缺乏，久泻致肝功受损，维生素K吸收减少和凝血酶原减低，而致出血。
5、其他
脱水重时可并发急性肾功能衰竭，此外有：中毒性肠麻痹，肠出血，肠穿孔，肠套叠和胃扩张，还可因输液不当引起急性心力衰竭，高钠或低钠血症，或高钾血症，小婴儿呕吐护理不周时可引起窒息。
