尿道结核的并发症包括尿道狭窄梗阻，严重时尿道结核可向周围蔓延，导致尿道皮肤瘘或尿道直肠(阴道)瘘。上行感染可以导致膀胱结核、膀胱挛缩、输尿管结核、肾结核。经血液循环可以蔓延到全身各组织和器官，造成腹膜结核、肺结核以及骨结核。故出现尿道结核的患者应行B超、CT、MRI明确是否有合并其他部位的结核。
