1.生育能力下降或不育：隐睾的病理主要是生殖细胞发育障碍，因此影响生育能力，一般而言，双侧隐睾者生育能力明显下降，但如隐睾位置较低，可望留有部分生育能力，单侧隐睾的生育能力，如对侧降入阴囊的睾丸与附睾发育正常，则影响不大。
2.鞘状突未闭：隐睾的鞘状突基本都未闭，有肠管疝入则形成斜疝，可发生嵌顿，手术要同时结扎鞘状突。
3.睾丸损伤：由于睾丸处在腹股沟管内或耻骨结节附近，比较表浅，容易受到外力的直接损伤。
4.隐睾扭转：未降睾丸发生扭转的几率较阴囊内睾丸高20～50倍，隐睾扭转一般表现为腹股沟部疼痛性肿块，颇似腹股沟疝嵌顿，但无明显胃肠道症状，右侧腹内隐睾扭转，其症状与体征颇似急性阑尾炎，故在小儿急腹症应注意检查阴囊内睾丸情况。
5.隐睾恶变：隐睾恶变的几率比正常睾丸高18～40倍，高位隐睾，特别是腹内隐睾，其恶变发生率比低位隐睾高6倍，6岁以前行睾丸固定术而后发生恶变的，比7岁以后手术者低得多，隐睾恶变的发病年龄多在30岁之后。
