1.早期发现病人，早确诊，早报告，就地隔离、治疗。
2.流脑病菌对日光、干燥、寒冷、湿热及消毒剂耐受力很差，所以要注意个人和环境卫生，保持室内的清洁，勤洗勤晒衣服和被褥;保持室内空气流通、新鲜。
3.流行期间做好卫生宣传，应尽量避免大型集会及集体活动，不要带孩子到病人家去串门，尽量不带孩子去公共场所如商店、影剧院、公园等游玩;如非去不可，应戴上口罩。
4.在流行病高峰季节里，如果发现孩子有发热、咽喉肿痛、头痛、呕吐、精神不好、皮肤出血点等症状应及时去医院诊治。
5.注意保暖，预防感冒。感冒时病人抵抗力会降低，容易受到流脑病菌的袭击而发病。因此，要随天气变化，随时增减衣服。在剧烈运动或从事劳动后，应及时把汗水擦干，穿好衣服。夜间睡觉时要盖好被子，对儿童更应留意这个问题。
6.在每顿进餐时，可吃上几瓣生大蒜，这样可以杀死口腔中的病菌。饭后盐水漱口，也有利于预防“流脑”的发生。
7.秋末冬初对5岁以内儿童接种流脑疫苗，保护率可达80～90%，抗病能力可维持1年左右;以后每年再打加强针一次。
8. 药物预防： 国内仍采用磺胺药，密切接触者可用碘胺嘧啶(SD)，成人2g/日，分2次与等量碳酸氢钠同服，连服3日;小儿每日为100mg/kg。在流脑流行时，凡具有：①发热伴头痛;②精神萎靡;③急性咽炎;④皮肤、口腔粘膜出血等四项中二项者，可给予足量全程的磺胺药治疗，能有效地降低发病率和防止流行。国外采用利福平或二甲胺四环素进行预防。利福平每日600mg，连服5日，1～12岁儿童每日剂量为10mg/kg。
9.菌苗预防： 目前国内外广泛应用A和C两群荚膜多糖菌苗。经超速离心提纯的A群多糖菌苗，保护率为94.9%，免疫后平均抗体滴度增加14.1倍。国内尚有用多糖菌苗作“应急”预防者，若1～2月份的流脑发病率大于10/10万，或发病率高于上一年同时期时，即可在人群中进行预防接种。
