霉菌性食管炎应防治相结合，特别应预防医源性因素所致的感染，严格掌握抗生素、激素使用的适应证，以减少该病的发生。
保护皮肤清洁和干燥，是预防外源性感染引起的霉菌型食管炎的重要措施。去掉各种诱因，不断提高机体抵抗力，对预防慢性疾病患者患本病更有意义。
