潜伏期为5～21天，平均在1周之内，临床经过可分为3期：
1.第1期 即外生殖器早期损害期，大致在性交感染后3天～3周，甚至3个月，在外生殖器上，如男性的冠状沟，包皮内侧，龟头或尿道口，女性的阴唇，阴道或子宫颈，出现针头大小丘疹，脓疱，并很快破溃形成溃疡，常为单个，有时2～3个，直径为1～4mm，圆形，边缘清楚，绕以红晕，触之不硬，亦无痛感，因而易被患者忽视，经过10天左右痊愈，不留瘢痕。
2.第2期 即腹股沟横痃期，在第1期损害发生1～4周后，腹股沟处酸痛而僵硬，旋即淋巴结开始肿大，融合成1个不甚规则，沿腹股沟略带梭形，中心高而外围较平的肿块，大小如鸡蛋或更大，表面呈紫色和青色，由于腹股沟韧带将淋巴结上下分开，皮肤呈槽沟状，各个淋巴结炎均先后化脓，穿孔，形成多数性瘘管，似“喷水壶状”，排出脓性或血液浆液，主觉疼痛，比下疳横痃要轻些，但影响行动，可有低热，食欲不振或全身不适，分布常为单侧，有时对称，后发的一侧，因已有一定的免疫力，常较小，较轻，而不一定化脓穿孔，称为顿挫性腹股沟淋巴肉芽肿横痃，女性很少发生腹股沟淋巴结炎，因其初疮常发生在阴道下部，向髂及肛门直肠淋巴结蔓延，引起髂及直肠周围淋巴结炎和直肠炎，导致腹痛及腰背痛。
3.第3期 即外生殖器象皮肿和直肠狭窄，距第1期1～2年，男性中象皮肿可累及阴茎(粗厚而坚实)，阴囊和下肢，同性恋者可发生肛门直肠狭窄，此在我国尚未见过，女性中象皮肿可非常突出，笔者曾见1例圆形阴唇象皮肿比鸡蛋还大，两侧阴唇像示指样向下延伸7～8cm，两侧对称，硬如象皮，略带褐色，末端微尖，开始时粪便中带脓血，逐渐排便困难，粪便形似铅笔，直肠指检发现肠壁变厚，在肛门上方5～6cm处有相当坚实之肿块，这种改变可能为环形，圆柱形或漏斗形，以后者多见，X线摄片可以证实，笔者曾见1例肛门外肿物如婴儿头大，直肠与膀胱相通，本期损害常多年不愈。
除上述3期所见围绕于生殖器，腹股沟和肛门的病变外，本病尚有其他少见病变，提示本病可能为全身性多系统性疾病，少见病变有：皮肤有多形红斑，结节红斑，发生于腹股沟横痃附近的红斑，结节，脓肿或溃疡，光敏皮肤反应常见：眼部有视盘周围水肿，眼底静脉扩张弯曲(治愈后消失，此病变不少见)和结膜炎。
其他有附睾炎，腹膜炎，溃疡性结肠炎，骨膜炎，关节炎，脑膜炎等，上海华山医院曾见1例本病引起的脑膜炎，因发生持续性癫痫而死亡。
