潜伏期长短不一，短者2～15天，长者1～3个月，本病分为急，慢性两期。
1.急性期 由于入口之囊蚴达肠后，经消化液作用，蚴虫脱囊而出，穿透肠壁进入腹腔，发育为童虫后在腹腔内移走，引起腹膜炎及粘连，1～3周内，多数童虫穿过横膈入胸腔，产生胸膜炎，最后入肺，形成囊肿，并发育为成虫而产卵，患者常在感染1周内出现畏寒，发热，呈弛张热，腹痛，腹泻，酱色大便，乏力，盗汗，食欲缺乏，2～3周后出现胸痛，咳嗽，气喘等胸部症状，此外，可有荨麻疹，白细胞总数及嗜酸性粒细胞增多。
2.慢性期 本期典型症状为咳嗽，咳血痰，常呈果酱样或烂桃样，痰中常可找到夏科-莱登晶体及大量虫卵，按主要病变及症状所在部位，可分下列各型：
(1)肺型：肺部主要病变是脓肿和囊肿，多位于横膈面，纵隔面或肺的浅层组织内，囊肿小者如米粒，大者直径达2cm，其中可找到虫卵，童虫或成虫，临床典型症状为咳嗽，咳血痰，常呈铁锈样，果酱样或烂桃样，胸痛时发时止，多在腋间或下胸部，少数可有呼吸困难，气喘或胸腔积液，体征多不明显，胸部X线检查早期可见边缘模糊，密度加深的圆形浸润性阴影;中期可见边缘锐利的圆形或椭圆形，单房或多房，囊性或实质性，大小不等的阴影;晚期可见大小不等的点状或索状致密阴影，胸膜粘连与增厚，肺型症状亦常与其他类型并存。
(2)腹型：当囊虫在腹腔内移行，可引起广泛的炎症性反应和粘连，并形成囊肿，分散各处或聚集成团，使腹膜表面粗糙不平，结肠及小肠浆膜充血，脏器和组织间有不同程度粘连，很少出现腹水，临床可有腹痛，腹泻，呕吐，便血等表现，偶见剧烈腹痛如急腹症，腹部有时可触及结节和包块。
(3)肠型：以腹痛，腹泻，黏液血便为主，大便中可找到虫卵。
(4)脑型：脑部病变多在颞叶和枕叶，亦可波及白质和内囊，基底部和侧脑室，以右侧多见，局部囊肿可致脑室通路阻塞，形成脑室萎缩或扩大，视神经受压等，囊内可见大量虫卵，有时可见虫体，脊髓病变多见于第10胸椎平面以下，可因虫体行走而引起病变部位的改变，临床上有发作性或持续性头痛，呕吐，癫痫，失语，视力障碍，颈项强直，凯尔尼格征和布鲁津斯基征可阳性。
(5)脊髓型：以四肢及躯干感觉异常，运动障碍，瘫痪，排尿排便困难等脊髓压迫症状为主。
(6)结节型：有时童虫贯穿至肌肉及皮下，发育为成虫，形成皮下结节和包块，镜观为典型嗜酸性肉芽肿，中心为灰黄色坏死组织，含夏科-莱登晶体，可查见虫卵，童虫或成虫，以皮下及肌肉结节为主要表现，以下腹部至大腿之间为多，次为背，臀，会阴部等处，位置较深，直径1.2cm，单个或数个相连，质较坚韧，能移动，稍有压痛，虫体离去后，结节炎症消退，留有细小纤维块。
本期临床特点：游走性，由于童虫或成虫游走，故常有旧病变消失，新病变出现，以致各种症状，体征此起彼伏，出没无常，变化多端，全身症状不明显，病人大多饮食正常，早期常见白细胞及嗜酸性粒细胞增多，脑型及脊髓型病人急性活动期常有颅压增高，细胞数轻度增加，并出现嗜酸性粒细胞，蛋白质轻度或中度增加，慢性病人如病变不活动，脑脊液正常，补体结合试验常呈阳性反应。
