由柯萨奇病毒或埃可病毒所致的病毒性脑膜炎，临床表现相似，婴幼儿，儿童及成人均可患病，起病急性或亚急性，发热，头痛，恶心，呕吐，腹痛，腹泻，喉痛，全身无力，较快出现颈部强直及典型的脑膜刺激征如Kernig征阳性，重者可出现昏睡等神经系统损害的症状，少数患者出现唇周疱疹应考虑是否为疱疹性病毒所致，腮腺肿大者当应考虑有腮腺炎病毒感染的可能。
病情轻重差异很大，取决于病变主要是在脑膜或脑实质，一般说来，病毒性脑炎的临床经过较脑膜炎严重，重症脑炎更易发生急性期死亡或后遗症。
1.病毒性脑膜炎 急性起病，或先有上感或前驱传染性疾病，主要表现为发热，恶心，呕吐，软弱，嗜睡，年长儿会诉头痛，婴儿则烦躁不安，易激惹，一般很少有严重意识障碍和惊厥，可有颈项强直等脑膜刺激征，但无局限性神经系统体征，病程大多在1～2周。
2.病毒性脑炎 起病急，但其临床表现因主要病理改变在脑实质的部位，范围和严重程度而有不同，病毒性脑炎病程大多2～3周。
(1)大多数患儿在弥漫性大脑病变基础上主要表现为发热，反复惊厥发作，不同程度意识障碍和颅压增高症状，惊厥大多呈全部性，但也可有局灶性发作，严重者呈惊厥持续状态，患儿可有嗜睡，昏睡，昏迷，深度昏迷，甚至去皮质状态等不同程度意识改变，若出现呼吸节律不规则或瞳孔不等大，要考虑颅内高压并发脑疝可能性，部分患儿尚伴偏瘫或肢体瘫痪表现。
(2)有的患儿病变主要累及额叶皮质运动区，临床则以反复惊厥发作为主要表现，伴或不伴发热，多数为全部性或局灶性强直-阵挛或阵挛性发作，少数表现为肌阵挛或强直性发作，皆可出现痫性发作持续状态。
(3)若脑部病变主要累及额叶底部，颞叶边缘系统，患者则主要表现为精神情绪异常，如躁狂，幻觉，失语以及定向力，计算力与记忆力障碍等，伴发热或无热，多种病毒可引起此类表现，但由单纯疱疹病毒引起者最严重，该病毒脑炎的神经细胞内易见含病毒抗原颗粒的包涵体，有时被称为急性包涵体脑炎，常合并惊厥与昏迷，病死率高。
其他还有以偏瘫，单瘫，四肢瘫或各种不自主运动为主要表现者，不少患者可能同时兼有上述多种类型表现，当病变累及锥体束时出现阳性病理征。
