临床表现主要根据感染部位不同和病情轻重不一而症状差异很大。
1.呼吸道感染：为最常见部位，多发生在有严重基础疾病的患者，如原有肺部疾患，长期卧床不起，接受大量广谱抗菌药物，气管切开，气管插管，人工辅助呼吸等，我国ICU患者呼吸道标本分离菌中，鲍曼不动杆菌排名第三(11%)，表现有发热，多为轻度或中度不规则发热，咳嗽，胸痛，气急，严重者可有发绀等表现，肺部可有中细湿Up音，胸部X线检查常表现为支气管肺炎，亦可为大叶性或片状浸润阴影，偶有脓肿或渗出性胸膜炎，可并发败血症及脑膜炎，痰培养和气管抽吸物培养有大量细菌生长，菌血症少见，如不及时治疗，则病死率较高(40%～64%)。
2.败血症：不动杆菌败血症主要发生于医院内感染，在败血症2576株病原菌中，医院内感染的不动杆菌在革兰阴性杆菌中仅次于大肠杆菌，假单胞菌属，与肺炎杆菌分离率几乎相等，约占8%，而在医院外感染九种革兰阴性杆菌败血症中，不动杆菌的发生率最少，不动杆菌败血症多发生在使用留置的动，静脉导管，导尿管或外科手术的患者，或患有严重基础疾病，长期应用肾上腺皮质激素或细胞毒药物等，常与呼吸道感染合并发生，患者有发热，毒血症症状，皮肤瘀点，肝脾肿大等，严重者可发生休克，本病的病死率颇高(17%～46%)，其中重要的原因是与该菌耐药和多种细菌合并感染有关，鲍曼不动杆感染的病情通常较重，病死率也较高。
3.脑膜炎：大多发生于颅脑手术后，也可为原发性感染，尤其在小儿中，诱发因素有颅脑外科手术，颅咽管瘤穿刺抽吸，腰椎穿刺等，临床表现有发热，头痛，呕吐，颈强直，凯尔尼格征阳性等化脓性脑膜炎改变，婴幼儿则有凝视，尖叫，惊厥，眼球震颤，前囟饱满紧张，骨缝增宽和四肢肌张力增高，皮肤亦可出现瘀点，瘀斑，临床上易误诊为流行性脑脊髓膜炎，应加以注意，同时还可并发脑室炎，脑脓肿，脑积水等，脑脊液检查外观混浊，细胞总数及中性粒细胞增高，蛋白质增高，糖含量降低，肺脊液涂片可见革兰阴性杆菌，可成双排列。
4.伤口、皮肤感染：创口感染占该菌感染总数的17.5%，发病率依次为外伤性感染，手术后感染，烧伤后创面感染，创口感染也可由本菌和其他细菌构成混合感染，如肠杆菌属，铜绿假单胞菌，肠球菌属，葡萄球菌属或化脓性链球菌造成混合感染，静脉导管污染本菌可引起严重的皮肤蜂窝织炎，严重的创口感染常合并败血症。
5.泌尿生殖道感染：仅次于呼吸系统。
6.心内膜炎：少见。可有脾大和皮疹体征。易侵犯主动脉瓣，有发热、寒战及神志改变和肢体瘫痪、继发心脏改变、血培养阳性。
7.化脓性腹膜炎：以硝酸盐阴性亚种所致者为主，其中在连续性非卧床腹膜透析者
8.其他：本菌尚可引起其他部位的感染，且形成化脓性炎症，如化脓性关节炎，骨髓炎，腹膜炎，腹腔脓肿，眼部感染和口腔脓肿等。
