本病潜伏期长短不一，可数天至2～3个月不等，临床可分为急性期，慢性期和异位损害。
1、急性期
主要由童虫在腹腔及肝脏移行所产生的症状，如合并有细菌感染可导致严重的后果，此期症状体征并不完全相同，主要有不规则发热(38～40℃)，右下腹痛，食欲缺乏，腹胀，腹泻或便秘，尚可有咳嗽，胸痛，右胸闻及湿性啰音及胸膜摩擦音等，多数有肝大，少数伴有脾大及腹水，上述症状可持续4个月左右而消退，并逐渐进入慢性期。
2、慢性期
当急性症状消退后，可数月或数年无明显不适，亦可在此期某些症状再次出现，如腹痛，腹泻，不规则发热以及反复荨麻疹，黄疸，贫血，低清蛋白，高免疫球蛋白血症，后两者是因虫体寄生的胆管上皮损伤，糜烂及成虫食血(每条使宿主失血约0.5ml/d所致)，由于成虫引起的胆管慢性炎症和增生，造成胆管纤维化以致肝硬化，亦可因成虫或胆管结石形成，使胆管阻塞引起阻塞性黄疸，进而发展成为胆汁性肝硬化。
3、异位损害
又称肝外肝片吸虫病，童虫在腹腔中移行穿入或被血流带至肝脏以外的脏器和组织，如腹壁肌肉等引起病变，中东个别地区人群有吃生羊肝的习惯，寄生在羊肝胆管的虫体可侵入人的咽部，引起局部水肿及充血，出现吞咽及呼吸困难，耳聋及窒息等，即咽部肝片吸虫病。
