主要有消化道出血，心律失常，气胸，DIC，浅层静脉血栓及肺栓塞，气管插管或切开的并发症，继发感染等。
1.发展为严重肺损伤和急性呼吸窘迫综合征：中枢性呼吸衰竭可以发展为呼吸机相关性肺炎和肺损伤，持续机械通气时，呼吸管理不善，可以导致气道肺泡发育不良，呼吸道细菌感染，发展为肺炎，加重呼吸衰竭，化疗和免疫抑制时，肠道缺血缺氧-再灌注性损伤等可以导致严重肺部感染性损伤，并发展为ARDS。
2.发展为肺外脏器功能衰竭：呼吸衰竭时持续低氧血症可以导致肺部和肺外脏器功能衰竭，主要由于肺部炎症细胞大量集聚，释放促炎症介质进入循环，攻击肺外脏器，导致肺外脏器的功能和结构损害，可以发展为多脏器功能障碍和衰竭。
