依据临床特点，结合流行病学资料，新生儿，婴幼儿，年长儿童的发病特点等，加上实验室等检查结果，可做出诊断。
大肠杆菌K100与嗜血流感杆菌可有交叉反应抗原存在，应注意鉴别，并应注意与其他病原引起的脑膜炎相鉴别。
