症状视患儿年龄及就诊早晚而异，有明显前驱症状者较多，常见流涕，咳嗽等，经数天或1～2周方出现脑膜刺激征，临床表现大致与各种细菌所致的化脑相仿，为中枢感染表现，颅压增高症状及脑膜刺激征，但各年龄组表现亦不一样。
1.儿童期脑膜炎： 与成人临床表现相似，起病急，高热，头痛，呕吐，食欲不振，精神萎靡，起病时神志清楚，病情进展可发现嗜睡，谵妄，甚至惊厥，昏迷，严重者在24h内出现频繁惊厥，昏迷，体检时可见意识障碍，颈强直，角弓反张，出现凯尔尼格征，布鲁津斯基征，巴宾斯基征阳性。
2.婴幼儿脑膜炎： 由于婴儿前囟未合，骨缝可裂开，颅内高压及脑膜刺激征可不典型，最先以激惹，烦躁，呕吐，面色苍白，继之嗜睡，哭声尖锐，眼神发呆，双目凝视，最易发生频繁惊厥，前囟饱满，布鲁津斯基征阳性是重要体征。
3.新生儿脑膜炎 ：常缺乏典型症状和体征，有时表现与败血症相似，发热可有可无，甚至体温不升，哭声微弱或呈高调，呕吐，拒食，呼吸不规则，发绀，黄疸，嗜睡，局部或全身隐匿性惊厥，查体可见前囟饱满，颈抵抗,少有其他脑膜刺激征，有时惟有腰穿检查脑脊液才能确诊，有些病儿直到尸检时方查出。
