血清与外分泌IgA水平显著降低;少数病人IgE和IgG2也减低，由于IgG2能对某些多糖类抗原产生较多的抗体，故这些病人容易反复发生鼻窦和肺部感染，甚至引致阻塞性肺疾病，然而，循环中IgA生成B细胞数并不低，本症病人接触血浆IgA或γ球蛋白后，会产生抗IgA抗体，以后如再输血或接触球蛋白便引起过敏反应，此外，本症病人还会产生抗甲状腺球蛋白，胃壁细胞，平滑肌，胶原和食物抗原的抗体，抗牛血清蛋白抗体的阳性率也增高，如采用牛抗血清检测IgA会掩盖IgA缺乏，因此，宜改用其他抗血清(如兔)进行测定，比较可靠。
