根据致病原因不同，性病相关性胃肠道感染有各种表现。
1.艾滋病的消化道表现腹泻是艾滋病的主要表现之一，特别是在发展中国家和热带地区，小肠性腹泻呈水样便，主要见于并发梨形鞭毛虫，隐孢子虫，等孢子球虫，小孢子虫感染者，其中隐孢子虫感染所致的腹泻易持续较长时间而转为慢性过程，结肠性腹泻呈黏液或脓血便，主要见于并发阿米巴肠病，菌痢和巨细胞病毒性肠炎，鸟型分支科菌感染，病变多在小肠和直肠，表现为发热，腹泻和消瘦;亦有表现为Whipple综合征者，男性多见，呈间歇性腹泻，粪便呈泡沫状，量多，恶臭，偶有游走性关节痛，紫癜，淋巴结肿大及多发性浆膜炎，抗结核药和肾上腺皮质激素治疗可缓解症状，肠道真菌性炎症腹泻频繁，大便常呈菜绿色，黏液胶冻状，涂片或培养可找到真菌，抗真菌治疗可暂时缓解症状。
2.性传播的感染性腹泻原虫感染者胃肠道症状无特异性，表现为腹泻，可伴腹痛或腹胀;细菌性感染可急性起病，出现发热，恶心及腹泻症状。
3.淋病：多数口咽淋病无临床症状，仅少数出现咽喉痛，患者可发生化脓性扁桃体炎，口腔炎，舌及颊黏膜溃疡。直肠淋病无特异症状，部分患者有直肠烧灼感，肛门瘙痒，血便或黏液便，甚至有腹泻。
4.梅毒：口腔病变最常见于唇部，亦可见于舌，口腔黏膜及扁桃体，表现为无痛性圆形溃疡性病变，即下疳，此外，肛门直肠也可见下疳，经2～4周后，原发病灶可自愈，此后3周～3个月则会发生二期梅毒，胃黏膜可广泛受累，临床上可出现腹痛，不伴恶心的呕吐及非厌食性消瘦。
5.病毒性感染：常见者为单纯疱疹病毒，巨细胞病毒及肝炎病毒感染，Ⅰ型单纯疱疹病毒主要累及口腔，表现为吞咽痛，厌食及发热等，Ⅱ型单纯疱疹病毒主要累及肛门，可表现为肛门直肠疼痛伴分泌物，也可出现腹泻或便秘，与肠黏膜表面接触的性行为可传播多种病毒，包括肝炎病毒，甲型肝炎在男性同性恋中发病较高，乙型和丙型肝炎可通过各种性行为传播。
