本征常合并眼部及全身先天异常，先天异常的发生率约为正常人群的20倍，有人报道有30%～50%患者伴有眼，骨骼，耳及神经组织的先天缺损。
1.眼部并发症 ：味觉-泪反射(gusto-lacrimal reflex)或称先天性鳄鱼泪(congenital crocodiletears)，上睑下垂，下睑外翻，色素痣，角膜皮样囊肿，圆锥角膜，小眼球，瞳孔不等，永存瞳孔残膜，虹膜异色，虹膜缺损，先天性白内障，永存玻璃体动脉，视神经盘移位，有髓神经纤维，辐辏功能不足，眼震等。
2.全身并发症： 听力障碍，外耳畸形，面神经麻痹，腭裂，齿畸形，脊柱异常，手脚畸形，Golden-hal综合征又称眼-耳-脊柱发育异常(结膜下皮样囊肿，耳有附件，脊柱发育异常)，Horner综合征等。
