菌感染后的临床表现多种多样，因感染部位不同而异，常见的临床表现有发热，以轻度或中度不规则发热为多，部分为弛张热，重者如脑膜炎，肺炎，败血病等体温较高，毒血症较重，婴儿感染后有神态萎靡，少动，少哭，推食，呕吐等中毒症状。
1.脑膜脓毒黄杆菌 本属中公认的致病菌，菽氏统计该菌引起的77例化脓性脑膜炎，新生儿占96.1%，儿童占1.3%，成人占2.6%，成人病例多见于年老体弱者。
陈氏报告1例肺炎，患者入院痰培养为变形杆菌，左肺尖外大片高密度影，曾给红霉素及头孢哌酮，一度好转，入院第3周发热又起，左心缘房胸片显示大片模糊影，左下肺底积液及外下包裹积液，痰培养3次该菌(FM)，除对羧苄西林，四环素中度敏感外，对其他多种青霉素，头孢菌素，氨基甙类，氯霉素及磺胺甲噁唑等均耐药，患者因昏迷，给人工机械通气，用四环素及青霉素病情好转，但气管插管脱出，又发生消化道出血，因吸入窒息而死，晏氏也曾报告1例患结节性弹力纤维变性伴黑头综合征，胸片为双下肺炎，疑双侧胸腔积液，抽取胸水620ml，为渗出液，后变为血性，入院1周痰培养为此菌，5天后变为纯培养，两天后死亡。
据Olsen检查男女泌尿生殖器的27600例体检中，检出114例脑膜败血性黄杆菌，其中来自女性者有100株，因此他认为女性生殖器可能成为该菌在医院的感染源，应引起足够的重视，同时他还在医院不同部位采集269份标本进行培养，其中33份阳性，在住院病人及医务人员中，也发现有呼吸道带菌者，甚至有报道，在消毒器械用的1‰氯己定浸液中也发现有此菌。
FM的治疗较为困难，因其对大多数抗生素耐药，曾有报道FM对红霉素，利福平，SMZco等少数几种抗生素敏感，Brown等对20株来自呼吸道的FM进行检测，全部对所试抗生素(包括第三代头孢霉素)均不敏感，惟独环丙沙星全部敏感，其中5例肺炎经环丙沙星治疗后，2例死亡，3例明显改善，Scully也报告FM对环丙沙星敏感，提示它可能为治疗FM的有效药物，值得注意的是，FM爆发流行，Brown 1989年曾报告为了防止绿脓杆菌感染，预防性的给予多黏菌素B雾化吸入，结果导致FM呼吸道感染流行，在两个半月时间内，在9例监护病人的20次痰培养中分离到FM，其中5例为FM肺炎，我国尚无大数例的肺炎报道，只能从个案报道中体会本菌肺炎的特点。
2.香气黄杆菌 1920年首先从肠道病人粪便中检出，其后在尿，血，痰，创伤和溃疡表面发现，金氏等曾报告1例急症脑内血肿患者，术后第4天，体温升高，呼吸困难，痰量增多，呈黄白色黏痰，有水果味，查体双肺有细啰音，少量哮鸣音，白细胞23.7×109/L，胸片双下肺感染，住院期间3次痰培养均示非发酵菌科黄杆菌，属芳香黄杆菌纯生长，菌株产生不溶性黄色素，有特殊芳香味，氧化酶试验阳性，先后予头孢他啶，氯霉素，苯唑西林等静滴，庆大霉素雾吸，酮康唑鼻饲等治疗，无效死亡。
3.多食黄杆菌，食酒精黄杆菌，黄杆菌Ⅱb群在临床可从痰，血，腹水，脑脊液，伤口，尿等中分离出，但报道较少，短黄杆菌及大比目鱼黄杆菌的致病性尚未确定，待积累资料后判定，汪氏等报告1例黄杆菌肺炎合并抗利尿激素综合征，患者低钠血症，血浆渗透压低于尿渗透压，且排除了其他原因，经相应治疗治愈出院。
